Optimized and validated protocol to the detection of the invasive bivalve Limnoperna fortunei from eDNA plankton samples
Protocolo otimizado e validado para detecção do bivalve invasor Limnoperna fortunei de amostras de DNA ambiental de plâncton
Josiane Ribolli; Sophia Cassol; Samara Hermes Silva; Evoy Zaniboni Filho; Flávia Lucena Zacchi; Jacó Joaquim Mattos; Grasiela Fagundes Minatto Cardoso; Alex Pires de Oliveira Nuñer
Abstract
Keywords
Resumo
Resumo: : Nós otimizamos uma metodologia para detecção do mexilhão-dourado em amostras de DNA ambiental de plâncton e a validamos em amostras de um reservatório no sul do Brasil. Limnoperna fortunei é uma espécie exótica invasora bem-sucedida que promove impactos significativos nos ecossistemas de água doce. Nós ajustamos e validamos a metodologia para detectar L. fortunei em amostras de plâncton em reservatório, através de ensaios com SYBR Green. O nível teórico mínimo de detecção de qPCR observado, com base na análise de curva padrão, foi de 0,0005625 ng.µL-1 (R2 = 0,99) em um ciclo de quantificação de 14,09–29,56. Nós também apresentamos um guia prático a ser utilizado no monitoramento da invasão de L. fortunei em bacias hidrográficas. A metodologia ajustada foi eficiente na detecção de L. fortunei e, portanto, pode ser usada para monitorar ambientes já infestados ou invasões em novos ambientes em larga escala.
Palavras-chave
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Submitted date:
08/03/2020
Accepted date:
03/31/2021
Publication date:
05/25/2021
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